re are 4 stages of biofilm formation: initial atașamentul, ireversibil atașamentul urmat, maturarea și dispersed. Click here to format this dinosaur microorganism din biofilm pentru tot parcursul dezvoltării.

Formarea biofilmului prin bacterii plutitoare în lumenul unui tub. Imaginați-vă credit: Blamb / Shutterstock

Biofilmels sunt destul de omniprezente și folosesc lor variază. For example, acestea sunt Adesea folosite în treaty of canalizare pentru a îndepărta compușii organici din apă, give pot fi găsiți și în mod natural în plăcile dentare și în înlocuirea șoldului. Instrument tei tehnologie pentru monitorizare și analiză tester și testează culorii, metabolizarea, genetizarea și fica.

Test de colorare

Povești Connect

Unul dintre first test of coloring used in analysis biofilmului to fost testul de cristal violet. În această metodă, molecular încărcat negative dintr-un biofilm (add polizaharidele EPS și bacteriile încărcate negative) is coloured with a colorant of violet crystal background. După acest proces de colorare, colorantul violet crystal this îndepărtat și quantificat. Cantitatea prezentă poate fi i support utilizată pentru a indicate dimensiuni biofilmului.

Cu toate acestea, această metodă sunt numărase limitări. Of example, this process of coloring are the reproductibilitate extrem de redusă și nu this capabil să facă distinction between celulele vii și cellulele moarte.

Prin urmare, au fost dezvoltate mai multe tehnici de culoare diferită a depune probleme, inclusiv testul 1,9-dimethyl methylene albastru (DMMB) care is leagă de Staphylococcus aureus cu the specificitate extremic de ridicat, testul de fluorescenă-di-acetate (FDA ) care to donate preluat of bacterii vii și fluoresc galben, uli testul BacLight LIVE / DEAD care poate distinction between cellulele bacteriene vii și cele mai multe.

Analiza metabolizată

Există mai multe tipuri de heads metabolized available for analysis biofilmului. For example, testul resazurinei implică resazurina cares this cells preluată converti convertită într-o resorufină roz-fluorescentă cares poate fi analizată prin analiză spectrofotoméă. Prin urmare, acest lucru permite analiza celulitei prin dinile-biofilm.

A high example of this testul BioTimer, lipss this preluat of bacterii și transform din roșu în galben în a metabolismoului fermentativ. Timpul necesar pentru schimbarea culorilor poate fi folosit pentru o analiză Dimensiunea biofilmului.

Analizează genetice

PCR cu transcriere cu inversare cantitativă în timp real (qRT-PCR) method use was high this frecvent utilization for biofilm analysis. Acest proces monitorizează să reacționeze pe PCR pentru întregul proces de ampare, permițând colectarea datelor în real timp. Semnalul fluorescent după fiecare ciclu poate fi used to indicate quantity of informa indicii genetice bacteriene viai viabilitatea tuturor cellulelor din biofilm.

Alternativ, analizați genetic acest utilizator pentru monitorizarea biofilmului pentru hibridizarea in situ a fluorescenței, pentru a da implicații principiului cu culoarea fluorescentă. Aceste dovedesc a fi capabile s-au folosit pentru o legătură de țintă din biofilm – allow to identification a different speci fi c atunci Când sunt associated with confocal microscopy with laser scan.

Analizați fizice

Există multe tehnologii diferite de microscopie disponibile pentru biofilm analysis, including apple spectroscopy, confocală microscopy cu scanare laser, electron microscopy, microscopy cu raze X și scanare probe microscopy. Method of access allows biofilmul fie fie imaginat și, prin urmare, să monitorizeze procesul biofilmului în timp real, precum și component al diferitelor biofilm.

În general, există mai multe instrumente disponibile pentru analiza biofilmului. Fiecare will address are advantageous și limitări diferite și, prin urmare, userea uni combinații this cea mai bună will address for to minimize erorile și to maximize quantity of information obținute din aceste structuri complex.https://harmoniqhealth.com/ro/recardio/

Surse

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: anul 23 2019

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Northern-Blot-RNA-Blot.aspx” Din

Introdus

Prima tehnică de blotare dezvoltată de Dr. Edwin Southern this numerotată Southern blot. Această tehnică a fost ulterior modiată astfel încât să detecteze old molecule țintă. Check out tehnici fiind variații ale Southern blot with fost denumite Northern blot, western blot și Eastern blot. Northern blot this used for a detectives specificity secondary to RNA-ului în-o probă. Prin urmare, se mai numete și blot RNA.

Principiu

În Northern blot, testați separatorul RNA-ul cu a gel of electroforeză activat. RNA fragment separate sunt transferate într-o membrană supports and support treaty with DNA probe mark. Dacă încercați să uses supplementary ARN, sample părăsește membrane cu poate și folosind diferite method.

Procedură

Pașii cheie în tehnica Northern blot sunt după cum urmează:

  • RNA test this separată mai întâi de marime using electrophoresis such as agaroză gel.Molecule of RNA forms dungi mai degrabă decât benzi pe gel, seems to exist mai multe mici fragment of RNA.
  • Moleculele of RNA sunt supports transferate pe or hârtie specială de șters, manufacturer of obicei din nitroceluloză. If folosește și membrană din nylon. Model of separate a RNA molecularor in the history of șters rămâne același cu cel din gel.
  • Acest suport expune probe DNA monocatenar. Bazele din această problemă se vor împerechea cu secvențele the complement of RNA in blot producer or molecular DNA-RNA cu dublă catenă. Deși sample nu poate fi văzută în această etapă, this needă această etichetă cu enzyme cu radioactive etichete cui cu tartament adecvat în stadiul urinar.
  • I support, probe, colorless substrate this transformative dintr-o enzyme într-un produs colorat și acest vizibilizator film cu X-raze.  

Cerere

Povești Connect

Unele dintre aplicații cheie ale Northern Blot sunt enumerate mai jos:

  • Studies on expresia genelor – pentru a observes supraexprimarea genelor care cauzează cancer și expresia genelor în caz de refuz a transplantului
  • În diagnosticul mai multor boli, exemplu, Boala Crohn
  • Pentru deterea microRNA-urilor viral care joacă roluri cheie în infectia virală
  • Recombinant depistarea pentru – prin detectrea format transgenic mRNA

Limitări ale Northern blot

Câteva limitări ale tehnicii Northern blot sunt discuss mai jos:

  • Metoda standard Northern blot aceasta este cea mai sensibilă în comparație cu testerul RT-PCR pentru protecția nucleate.
  • You need or cantitate mare de secvență de probă de RNA țintă, în timp ce tehnici mai noi, according to the RT-PCR în actual timp, you need to do or singură copy of RNA pentru ampare.
  • Tehnica Northern blot this very sensitive clair și la o ușoară will degrade to RNA probelor. Degradarea affectează drastic calitatea și cuantificarea informațiilor.
  • Tehnica devine laborioasă în cazurile în care trebuie adăugate never fines probes. Or to give a sound poate fi adăugat sistemul numi după scoaterea completă a first probe. Acest lucru poate face procesul extrem de complex. După will treat the system with the substance of the last pentru to eliminate the prima probă, accurate the date din rundele ulterioare poate fi, de asemenea, Compromise.
  • Northern blot poate mura donate cumulation of mRNA in the stencil of echilibru și nu stabilitatea RNA sau transcription ratele.

dacă prelinge

Tehnica Northern blot this a classic mod of an analysis prezența uni secvențe specific of RNA într-o probă. Northern blot această relativă la simpla efuat din laborator. Recent progress in tampoane membranei hibridizare membrane to the permit ștergerea Sensitilităilor ridicate. Cu toate testele, decoperirea tehnologiei PCR în ultimul timp și permite ca identitatea să fie simplificată, rapidă, precisă, precum anti-cuantifică ARN-ului.

Consultați

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: 23 august 2018

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Protein-Protein-Interactions.aspx” Din

Proteinele din interiorul celulelor trebuie să se exercite în funcții generale în multiproteice complex. Acești complex sunt consider a fi structuri foarte dynamice care schimbă compoziția în timp și starea celulară, a cărui protejat poate îndeplini funcții diferite în funcție de partenerii săi de legare. Asstfel de interacțiuni joacă a vital role in the cellular process, prin urmare studierea rețelelor de proteine ​​care interacționează poate oferi o perspectivă de biologie fundamentală.

The multitude of method au fost dezvoltate și îmbunătățite de-a lungul anilor pentru investigate the interacțiunilor proteină-proteină. Proteomica bazată pe spectrometrie de masă cantitativă combinată cu protocoale de purificare a Afinității a devenit metodică aleasă pentru cartografierea mi urmează schimbări dinamice în interacțiuni proteină-semi-protein – including cellular timeliness including even cellular locific-cellular-protein.

Interacțiunea cueleele proteice

Structure of nature rețelelor of interaction with proteinele, care sunt esențiale pentru buna funcționare a mechanismelorolekulare de bază care stau the asset vieții cellular, this cel mai bine apreciat în rețelele biologice ca part of biologiei sistemor complex of dateit, îgate interiiti s specialist protein available studiu .

Rețlele interacțiunii cu proteinele prin elucidarea rezistenței moleculare bolilor, îngrijirea, rândul lor, și prin metoda mai bună de prevent, diagnostic șiertrament. Or analy an an astfel de rețele poate ajuta, of also, the evaluation of medical capacitatea țintelor molecular din rețelei topology, delimit and motivate frequent interaction with rețelei, perform and compare fiable, comprehensive organismele model.

Povești Connect

Rețelele de interacțiune cu proteinele pot fi create folosind interacțiuni proteice de deice methodă experimentale sau combination of multiple experimental method și seturi de dată, în care fiecare proteină este reprezentată de un nod și două sunt bound protein între elieeda dacă fie.

Method of studiu a proteină-proteină interacțiuniilor

Sistemul cu două hibrizi de drojdie (initial publication in 1989) allows prophylaxis of interacțiuniilor proteice ale oricăror două proteice, care pot fi mărite pentru a acoperi întregul proteom un organism. Această tehnică a fost aplicată cu succes pentru deterarea interacțiunilor proteină-proteină a diferitelor specii eukaryote, cum ar fi Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, precum acestea pentru interacțiunea comună umană.

Purificarea Afinității spectrometriei de masă (APMS) if bazează pe purificarea biochimică din protein extract din celuloză. După purificare, proteinele care sunt legate (pradă) from proteină purificată (momeală) sunt determinate folosind mass spectrometry. Aceste strategii sunt folosite pentru a identifica interacțiunea dintre proteice și condițiile fiziologice ale interiorului celulei.

Pentru identitatea interacțiunilor slabe efi epemere ale proteinelor, care was lost în timpul etapelor de spălare în normal protocoalele de purificare, au fost dezvoltate tackle de reticulare chimică. Prin reticulare reversibilă, clar și proteinele care interacționează slab devin puternic asociat cu momeala sau complexul proteic purificat prin formarea de legături covalente și pot fi purificat biochimic.

Or provoke esențială în analysis seturilor mari de date constă în differentia interacțiuniilor proteice adevărate de zgomotul experimental care exist în datele brute obținute printr-o screening method la scară largă. Acest lucru are fog of metode solid pentru calculate scorurilor de încredere pentru interacțiuni proteină-proteină.

Surse

  1. Mishra NC. Enter în Proteomică: Principii și aplicații. John Wiley Fiii, 2011; pp. 115-136.

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: 23 august 2018

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Ras-Genes-and-Cancer.aspx” Din

Genele Ras codifying protein care pot produce cancer (sau pot devine oncogen) tonul poate fi mutant. Toate proteinele Ras sunt GTPaze care acționează ca într-o altă moleculă în celulă, reglând căile de semnalizare intei vechi interacțiuni.  

Imaginați-vă credit: Kateryna Kon / Shutterstock.com

There is Ras protein, care sunt express omniprezent în organism. Hit sunt gene; H-ras, K-ras și N-ras. Obțineți gena pentru participation in the Ras-Raf-MAPK datorită a avut implicații în procesul de critică via cell ale.

Proteinele Ras sunt în mod normal strans reglementate de factori care opresc activitate GTPazei. Proteinele family Ras GTPase într-un rol în cadrul uni serii de procese, including progresia cellular cyclului, creterea, migrenă, modiarea cyto-skeletice, apoptoză și senescență.

Mutații Ras

Când funcționează fără această regulă de răspuns, it looks a fi hyper-proliferant din cauza lipsei de cancer. Mutații specifice the codonii 12, 13 sau 61 din genele Ras sunt associate cu tumors.

Aceste mutații favorizează activitatea constitutivă a Ras, ceea ce trebuie să genă acest lucru întotdeauna „pornită” și există sau supraproducție a protei. Mutația crește, de asemenea, legarea GTP, ducând la supraactivitate.

Anumite mutații ale liniei germinale în Ras și în alți membri ai căilor Ras-MAPK conduct the constitutive activarea to căii, give într-o masură mai mică decât cea găsită în tumors. Hit tipuri de mutații sunt legate de unele Sindroame dezvoltare.

Povești Connect

Genele neurofibromatozei 1 (NF1) encodes or activates protein to Ras GTPase care cauzează neurofibromatoza of tip 1. Alrii members ai căii Ras au fost connect the syndromic precum sindroamele Noonan, Costello, cardiofaciocutane, Legius și Leopard. Activate the Ras poate a contribution, similar, to the boli, cum ar fi diabetul non-obez și retinopathy diabetică.

Mutații Ras în cancer

Mutațiile H-ras, N-ras și K-ras sunt even foarte frecvente care declanșează dezvoltarea tumorilor. Până la 30 la sută din toate human tumor misdirected au mutație ras. Whales if gelsome cel mai frecventin locusul K-ras, the approximate 25-30 the sută din toate tumor probele.

Mutații N-ras if găsesc în approximate 8% dintre tumori și donate aproximativ 3% în mutații H-ras. Studiile performate pe oareci knockout au arătat că N-ras și H-ras sunt dispensabile din punct de vedere to the reliever of physiology, give K-ras this necessary for normal development to șoarecilor. Acest lucru susține theory conform căreia K-ras este mai semificativ în dezvoltarea cancerului.

Unele tipuri de cancer în care se găsesc frecvent mutații ras includ:

Adenocarcinom pancreatic ductal

Adenocarcinoamele pancreatice sunt o parte a acestui lucru care poate detecta tumori, înainte de dureri care pot fi agresive și care pot rezulta. Hey, also, cea mai mare incidență a mututa ras din toate tipurile de cancer uman. Majoritatea acestor mutații afectează în K-ras the codonul 12. It is created că mutații K-ras aparte foarte devreme în. Chiar probei probele from the paienii panii cu pancreatită chonică prezintă sau rată ridicată a mutațiilor K-ras.

Carcinom colorectal

Mutații K-ras if generează 40-45% în testul carcinomului colorectal. Majoritatea acestor mutații afetează codonii 12 13.i 13. The fel ca în cazul adenocarcinomului pancreatic, is thought to be a mutaileiile K-ras apart from devreme în cursul bolii. Unele studii au arătat sau corelație între mutații K-ras și prognosticul slab.

Lung carcinom cu mici cell (NSCLC)

Mutații K-ras explica 16-40% din tumori probele. Un rol mutațional este creat de NSCLC. Actually pot fi timidly timpurii în cursul bolilor și pot apărea expunerea pe termen lung la substanțe chimice precum tutunul, azbestul și cărbunele.

There are 4 stages of biofilm formation: initial atașamentul, ireversibil atașamentul urmat, maturarea și dispersed. Click here to format this dinosaur microorganism din biofilm pentru tot parcursul dezvoltării.

Formarea biofilmului prin bacterii plutitoare în lumenul unui tub. Imaginați-vă credit: Blamb / Shutterstock

Biofilmels sunt destul de omniprezente și folosesc lor variază. For example, acestea sunt Adesea folosite în treaty of canalizare pentru a îndepărta compușii organici din apă, give pot fi găsiți și în mod natural în plăcile dentare și în înlocuirea șoldului. Instrument tei tehnologie pentru monitorizare și analiză tester și testează culorii, metabolizarea, genetizarea și fica.

Test de colorare

Povești Connect

Unul dintre first test of coloring used in analysis biofilmului to fost testul de cristal violet. În această metodă, molecular încărcat negative dintr-un biofilm (add polizaharidele EPS și bacteriile încărcate negative) is coloured with a colorant of violet crystal background. După acest proces de colorare, colorantul violet crystal this îndepărtat și quantificat. Cantitatea prezentă poate fi i support utilizată pentru a indicate dimensiuni biofilmului.

Cu toate acestea, această metodă sunt numărase limitări. Of example, this process of coloring are the reproductibilitate extrem de redusă și nu this capabil să facă distinction between celulele vii și cellulele moarte.

Prin urmare, au fost dezvoltate mai multe tehnici de culoare diferită a depune probleme, inclusiv testul 1,9-dimethyl methylene albastru (DMMB) care is leagă de Staphylococcus aureus cu the specificitate extremic de ridicat, testul de fluorescenă-di-acetate (FDA ) care to donate preluat of bacterii vii și fluoresc galben, uli testul BacLight LIVE / DEAD care poate distinction between cellulele bacteriene vii și cele mai multe.

Analiza metabolizată

Există mai multe tipuri de heads metabolized available for analysis biofilmului. For example, testul resazurinei implică resazurina cares this cells preluată converti convertită într-o resorufină roz-fluorescentă cares poate fi analizată prin analiză spectrofotoméă. Prin urmare, acest lucru permite analiza celulitei prin dinile-biofilm.

A high example of this testul BioTimer, lipss this preluat of bacterii și transform din roșu în galben în a metabolismoului fermentativ. Timpul necesar pentru schimbarea culorilor poate fi folosit pentru o analiză Dimensiunea biofilmului.

Analizează genetice

PCR cu transcriere cu inversare cantitativă în timp real (qRT-PCR) method use was high this frecvent utilization for biofilm analysis. Acest proces monitorizează să reacționeze pe PCR pentru întregul proces de ampare, permițând colectarea datelor în real timp. Semnalul fluorescent după fiecare ciclu poate fi used to indicate quantity of informa indicii genetice bacteriene viai viabilitatea tuturor cellulelor din biofilm.

Alternativ, analizați genetic acest utilizator pentru monitorizarea biofilmului pentru hibridizarea in situ a fluorescenței, pentru a da implicații principiului cu culoarea fluorescentă. Aceste dovedesc a fi capabile s-au folosit pentru o legătură de țintă din biofilm – allow to identification a different speci fi c atunci Când sunt associated with confocal microscopy with laser scan.

Analizați fizice

Există multe tehnologii diferite de microscopie disponibile pentru biofilm analysis, including apple spectroscopy, confocală microscopy cu scanare laser, electron microscopy, microscopy cu raze X și scanare probe microscopy. Method of access allows biofilmul fie fie imaginat și, prin urmare, să monitorizeze procesul biofilmului în timp real, precum și component al diferitelor biofilm.

În general, există mai multe instrumente disponibile pentru analiza biofilmului. Fiecare will address are advantageous și limitări diferite și, prin urmare, userea uni combinații this cea mai bună will address for to minimize erorile și to maximize quantity of information obținute din aceste structuri complex.https://harmoniqhealth.com/ro/recardio/

Surse

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: anul 23 2019

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Northern-Blot-RNA-Blot.aspx” Din

Introdus

Prima tehnică de blotare dezvoltată de Dr. Edwin Southern this numerotată Southern blot. Această tehnică a fost ulterior modiată astfel încât să detecteze old molecule țintă. Check out tehnici fiind variații ale Southern blot with fost denumite Northern blot, western blot și Eastern blot. Northern blot this used for a detectives specificity secondary to RNA-ului în-o probă. Prin urmare, se mai numete și blot RNA.

Principiu

În Northern blot, testați separatorul RNA-ul cu a gel of electroforeză activat. RNA fragment separate sunt transferate într-o membrană supports and support treaty with DNA probe mark. Dacă încercați să uses supplementary ARN, sample părăsește membrane cu poate și folosind diferite method.

Procedură

Pașii cheie în tehnica Northern blot sunt după cum urmează:

  • RNA test this separată mai întâi de marime using electrophoresis such as agaroză gel.Molecule of RNA forms dungi mai degrabă decât benzi pe gel, seems to exist mai multe mici fragment of RNA.
  • Moleculele of RNA sunt supports transferate pe or hârtie specială de șters, manufacturer of obicei din nitroceluloză. If folosește și membrană din nylon. Model of separate a RNA molecularor in the history of șters rămâne același cu cel din gel.
  • Acest suport expune probe DNA monocatenar. Bazele din această problemă se vor împerechea cu secvențele the complement of RNA in blot producer or molecular DNA-RNA cu dublă catenă. Deși sample nu poate fi văzută în această etapă, this needă această etichetă cu enzyme cu radioactive etichete cui cu tartament adecvat în stadiul urinar.
  • I support, probe, colorless substrate this transformative dintr-o enzyme într-un produs colorat și acest vizibilizator film cu X-raze.  

Cerere

Povești Connect

Unele dintre aplicații cheie ale Northern Blot sunt enumerate mai jos:

  • Studies on expresia genelor – pentru a observes supraexprimarea genelor care cauzează cancer și expresia genelor în caz de refuz a transplantului
  • În diagnosticul mai multor boli, exemplu, Boala Crohn
  • Pentru deterea microRNA-urilor viral care joacă roluri cheie în infectia virală
  • Recombinant depistarea pentru – prin detectrea format transgenic mRNA

Limitări ale Northern blot

Câteva limitări ale tehnicii Northern blot sunt discuss mai jos:

  • Metoda standard Northern blot aceasta este cea mai sensibilă în comparație cu testerul RT-PCR pentru protecția nucleate.
  • You need or cantitate mare de secvență de probă de RNA țintă, în timp ce tehnici mai noi, according to the RT-PCR în actual timp, you need to do or singură copy of RNA pentru ampare.
  • Tehnica Northern blot this very sensitive clair și la o ușoară will degrade to RNA probelor. Degradarea affectează drastic calitatea și cuantificarea informațiilor.
  • Tehnica devine laborioasă în cazurile în care trebuie adăugate never fines probes. Or to give a sound poate fi adăugat sistemul numi după scoaterea completă a first probe. Acest lucru poate face procesul extrem de complex. După will treat the system with the substance of the last pentru to eliminate the prima probă, accurate the date din rundele ulterioare poate fi, de asemenea, Compromise.
  • Northern blot poate mura donate cumulation of mRNA in the stencil of echilibru și nu stabilitatea RNA sau transcription ratele.

dacă prelinge

Tehnica Northern blot this a classic mod of an analysis prezența uni secvențe specific of RNA într-o probă. Northern blot această relativă la simpla efuat din laborator. Recent progress in tampoane membranei hibridizare membrane to the permit ștergerea Sensitilităilor ridicate. Cu toate testele, decoperirea tehnologiei PCR în ultimul timp și permite ca identitatea să fie simplificată, rapidă, precisă, precum anti-cuantifică ARN-ului.

Consultați

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: 23 august 2018

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Protein-Protein-Interactions.aspx” Din

Proteinele din interiorul celulelor trebuie să se exercite în funcții generale în multiproteice complex. Acești complex sunt consider a fi structuri foarte dynamice care schimbă compoziția în timp și starea celulară, a cărui protejat poate îndeplini funcții diferite în funcție de partenerii săi de legare. Asstfel de interacțiuni joacă a vital role in the cellular process, prin urmare studierea rețelelor de proteine ​​care interacționează poate oferi o perspectivă de biologie fundamentală.

The multitude of method au fost dezvoltate și îmbunătățite de-a lungul anilor pentru investigate the interacțiunilor proteină-proteină. Proteomica bazată pe spectrometrie de masă cantitativă combinată cu protocoale de purificare a Afinității a devenit metodică aleasă pentru cartografierea mi urmează schimbări dinamice în interacțiuni proteină-semi-protein – including cellular timeliness including even cellular locific-cellular-protein.

Interacțiunea cueleele proteice

Structure of nature rețelelor of interaction with proteinele, care sunt esențiale pentru buna funcționare a mechanismelorolekulare de bază care stau the asset vieții cellular, this cel mai bine apreciat în rețelele biologice ca part of biologiei sistemor complex of dateit, îgate interiiti s specialist protein available studiu .

Rețlele interacțiunii cu proteinele prin elucidarea rezistenței moleculare bolilor, îngrijirea, rândul lor, și prin metoda mai bună de prevent, diagnostic șiertrament. Or analy an an astfel de rețele poate ajuta, of also, the evaluation of medical capacitatea țintelor molecular din rețelei topology, delimit and motivate frequent interaction with rețelei, perform and compare fiable, comprehensive organismele model.

Povești Connect

Rețelele de interacțiune cu proteinele pot fi create folosind interacțiuni proteice de deice methodă experimentale sau combination of multiple experimental method și seturi de dată, în care fiecare proteină este reprezentată de un nod și două sunt bound protein între elieeda dacă fie.

Method of studiu a proteină-proteină interacțiuniilor

Sistemul cu două hibrizi de drojdie (initial publication in 1989) allows prophylaxis of interacțiuniilor proteice ale oricăror două proteice, care pot fi mărite pentru a acoperi întregul proteom un organism. Această tehnică a fost aplicată cu succes pentru deterarea interacțiunilor proteină-proteină a diferitelor specii eukaryote, cum ar fi Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, precum acestea pentru interacțiunea comună umană.

Purificarea Afinității spectrometriei de masă (APMS) if bazează pe purificarea biochimică din protein extract din celuloză. După purificare, proteinele care sunt legate (pradă) from proteină purificată (momeală) sunt determinate folosind mass spectrometry. Aceste strategii sunt folosite pentru a identifica interacțiunea dintre proteice și condițiile fiziologice ale interiorului celulei.

Pentru identitatea interacțiunilor slabe efi epemere ale proteinelor, care was lost în timpul etapelor de spălare în normal protocoalele de purificare, au fost dezvoltate tackle de reticulare chimică. Prin reticulare reversibilă, clar și proteinele care interacționează slab devin puternic asociat cu momeala sau complexul proteic purificat prin formarea de legături covalente și pot fi purificat biochimic.

Or provoke esențială în analysis seturilor mari de date constă în differentia interacțiuniilor proteice adevărate de zgomotul experimental care exist în datele brute obținute printr-o screening method la scară largă. Acest lucru are fog of metode solid pentru calculate scorurilor de încredere pentru interacțiuni proteină-proteină.

Surse

  1. Mishra NC. Enter în Proteomică: Principii și aplicații. John Wiley Fiii, 2011; pp. 115-136.

Lecturi înainte de suplimente

Ultima actualizare: 23 august 2018

„Http://www.news-medical.net/life-sciences/Ras-Genes-and-Cancer.aspx” Din

Genele Ras codifying protein care pot produce cancer (sau pot devine oncogen) tonul poate fi mutant. Toate proteinele Ras sunt GTPaze care acționează ca într-o altă moleculă în celulă, reglând căile de semnalizare intei vechi interacțiuni.  

Imaginați-vă credit: Kateryna Kon / Shutterstock.com

There is Ras protein, care sunt express omniprezent în organism. Hit sunt gene; H-ras, K-ras și N-ras. Obțineți gena pentru participation in the Ras-Raf-MAPK datorită a avut implicații în procesul de critică via cell ale.

Proteinele Ras sunt în mod normal strans reglementate de factori care opresc activitate GTPazei. Proteinele family Ras GTPase într-un rol în cadrul uni serii de procese, including progresia cellular cyclului, creterea, migrenă, modiarea cyto-skeletice, apoptoză și senescență.

Mutații Ras

Când funcționează fără această regulă de răspuns, it looks a fi hyper-proliferant din cauza lipsei de cancer. Mutații specifice the codonii 12, 13 sau 61 din genele Ras sunt associate cu tumors.

Aceste mutații favorizează activitatea constitutivă a Ras, ceea ce trebuie să genă acest lucru întotdeauna „pornită” și există sau supraproducție a protei. Mutația crește, de asemenea, legarea GTP, ducând la supraactivitate.

Anumite mutații ale liniei germinale în Ras și în alți membri ai căilor Ras-MAPK conduct the constitutive activarea to căii, give într-o masură mai mică decât cea găsită în tumors. Hit tipuri de mutații sunt legate de unele Sindroame dezvoltare.

Povești Connect

Genele neurofibromatozei 1 (NF1) encodes or activates protein to Ras GTPase care cauzează neurofibromatoza of tip 1. Alrii members ai căii Ras au fost connect the syndromic precum sindroamele Noonan, Costello, cardiofaciocutane, Legius și Leopard. Activate the Ras poate a contribution, similar, to the boli, cum ar fi diabetul non-obez și retinopathy diabetică.

Mutații Ras în cancer

Mutațiile H-ras, N-ras și K-ras sunt even foarte frecvente care declanșează dezvoltarea tumorilor. Până la 30 la sută din toate human tumor misdirected au mutație ras. Whales if gelsome cel mai frecventin locusul K-ras, the approximate 25-30 the sută din toate tumor probele.

Mutații N-ras if găsesc în approximate 8% dintre tumori și donate aproximativ 3% în mutații H-ras. Studiile performate pe oareci knockout au arătat că N-ras și H-ras sunt dispensabile din punct de vedere to the reliever of physiology, give K-ras this necessary for normal development to șoarecilor. Acest lucru susține theory conform căreia K-ras este mai semificativ în dezvoltarea cancerului.

Unele tipuri de cancer în care se găsesc frecvent mutații ras includ:

Adenocarcinom pancreatic ductal

Adenocarcinoamele pancreatice sunt o parte a acestui lucru care poate detecta tumori, înainte de dureri care pot fi agresive și care pot rezulta. Hey, also, cea mai mare incidență a mututa ras din toate tipurile de cancer uman. Majoritatea acestor mutații afectează în K-ras the codonul 12. It is created că mutații K-ras aparte foarte devreme în. Chiar probei probele from the paienii panii cu pancreatită chonică prezintă sau rată ridicată a mutațiilor K-ras.

Carcinom colorectal

Mutații K-ras if generează 40-45% în testul carcinomului colorectal. Majoritatea acestor mutații afetează codonii 12 13.i 13. The fel ca în cazul adenocarcinomului pancreatic, is thought to be a mutaileiile K-ras apart from devreme în cursul bolii. Unele studii au arătat sau corelație între mutații K-ras și prognosticul slab.

Lung carcinom cu mici cell (NSCLC)

Mutații K-ras explica 16-40% din tumori probele. Un rol mutațional este creat de NSCLC. Actually pot fi timidly timpurii în cursul bolilor și pot apărea expunerea pe termen lung la substanțe chimice precum tutunul, azbestul și cărbunele.